平成16年３月	但東町三原に新但東中学校完成、竣工式を行う
４月	但東北中学校、但東中学校の両校を統合し、但東中学校として開校する
４月	初代校長として西垣勝美校長が着任する
４月	校旗、校歌を制定する
６月	「但東中学校の開校を祝う集い」を行う
１０月	台風２３号の来襲により、甚大な被害を受け、３日間臨時休校となる
平成17年４月	１市５町（豊岡市・但東町・出石町・日高町・城崎町・竹野町）が合併し、豊岡市となる
10月	但馬中学校国語教育研究会を本校で開催
平成18年４月	第２代校長として大石義博校長が着任する
４月	「生き生きと自己表現できる生徒の育成」を学校教育目標に掲げ、表現力を培う授業づくりに取り組む
10月	のじぎく国体「フィールドゴルフ大会」に全校生徒が参加する
平成19年４月	文科省人権教育地域指定の研究委託を受け、小中合同で取り組む
10月	「ひょうごの匠」キャラバン隊派遣事業を実施する
平成20年8月	国際交流として４名の生徒がモンゴルを訪問する
平成21年２月	全校生参観の公開授業を実施する
４月	第３代校長として田渕守校長が着任する
８月	関西吹奏楽コンクール　金賞受賞
１１月	青年の主張全国大会奨励賞受賞
平成22年８月	国際交流として３名の生徒がモンゴルを訪問する。
11月	「ひょうごの匠」キャラバン隊派遣事業を実施する。
平成23年10月	モンゴル研修生を受け入れる
11月	「ようこそ先輩」事業（渋谷秀敏氏による講演）
平成24年10月	兵庫県中学校教育研究会社会科教育研究大会に１年生が参加
平成25年４月	第４代校長として柳原守校長が着任する
10月	モンゴル研修生と交流
平成26年３月	「ひょうごの匠」キャラバン隊派遣事業を実施する。